种业研究
种质资源精准评价
通过全基因组重测序、Hyper-seq 和高通量基因分型，建立种质资源遗传多样性档案，识别优异等位变异和核心种质材料。
重要农艺性状定位
结合 GWAS、QTL 定位、选择信号分析和表型数据，挖掘产量、品质、抗逆、熟期和株型等性状相关候选基因。
分子标记辅助选择
围绕目标性状开发可验证、可追踪的 SNP/InDel 标记，支持亲本筛选、背景回复率评估和后代材料快速鉴定。
基因组选择育种
以高密度基因型和多环境表型为基础构建预测模型，辅助早代选择和组合设计，缩短育种周期。
品种鉴定与溯源
构建 DNA 指纹图谱，用于品种真实性鉴定、纯度检测、种源追踪和资源保护。
微生物研究
农业与环境微生物基因组测序
对根际菌、发酵菌、工程菌和环境菌株进行全基因组测序，解析菌株差异、功能基因、质粒结构和系统发育关系。
土壤与环境微生物群落分析
研究土壤、水体、发酵体系和植物根际微生物群落的多样性、功能潜力与生态互作。
功能基因与代谢通路解析
识别与氮磷循环、抗逆促生、发酵代谢和环境适应相关的功能基因，为菌株筛选和工艺优化提供依据。
益生菌功能分析
分析益生菌的基因组成和代谢能力，用于益生菌产品开发。
环境微生物多样性研究
评估水体、空气、土壤等环境中的微生物群落组成，监测环境质量。
动植物研究
作物育种与遗传改良
利用Hyper-seq等技术进行大规模群体基因型分析，加速育种进程，培育高产、抗逆优良品种。
动物育种选择
对畜禽、水产进行基因组选择，提高生长、繁殖、品质和环境适应等生产性状。
物种进化与系统学研究
通过基因组比较，揭示物种进化历史和系统发育关系。
核心种质资源评估
对种质资源库进行基因组学特征分析，建立遗传多样性档案，指导资源有效利用。
生物多样性监测
对野生动植物种群进行基因组监测，评估遗传多样性、群体结构和适应性变化。
特性相关基因发现
通过GWAS等方法发现控制性状的候选基因，用于功能研究和育种应用。